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適用人群不同
據市醫療保險事業處主任孫某介紹，城鎮職工醫療保險的適用人群為城鎮所有用人單位的職工，包括企業(國有企業、集體企業、外商投資企業、港澳臺商投資企業、私營企業等)、機關、事業單位、社會團體、民辦非企業等單位的職工。
城鎮居民醫療保險的適用人群為，城鎮職工基本醫療保險和新型農村合作醫療覆蓋范圍以外的城鎮居民,主要包括未成年居民,指中小學階段學生(含職業高中、中專、技校學生)、學齡前兒童及其他未滿18周歲的未成年居民;老年居民，指男滿60周歲、女滿55周歲以上的城鎮居民;以及其他非從業的城鎮成年居民。大學生將來也要納入城鎮居民醫療保險范圍。
繳費方式不同
城鎮職工醫療保險是根據單位的職工工資總額按一定的繳費比例,由單位統一繳納;其中單位要承擔職工工資總額7%,個人承擔本人繳費工資基數的2%。今年由于經濟危機對企業的經營造成的一定的影響，從今年4月到12月時間段內，將企業單位的繳費由7%下調至6%，以減輕企業負擔。
城鎮居民醫療保險是個人通過所在居委會或學校(幼兒園)繳費，同時政府在個人和家庭繳費的基礎上給予補助。未成年居民、成年居民、老年居民的基金籌集標準每人每年分別為100元、360元、360元，其中個人繳納分別為40元、280元、150元;政府補助分別為60元、60元、210元。可以看出，城鎮居民醫療保險的籌集標準要比城鎮職工醫療保險低很多，約為城鎮職工醫療保險基金人均籌資額的1/5。
享受待遇不同
參加城鎮職工醫療保險的職工可享受住院費用報銷、統籌病種門診費用報銷以及用于支付門診醫療費的個人帳戶待遇，其報銷比例較城鎮居民醫療保險高一些。在職職工住院的費用，在扣除范圍外費用以后，最低起付線以上至5000元的部分，按75%報銷;5000元至10000元的部分按80%報銷;10000元以上的部分按85%報銷，退休人員相應提高10%;統籌病種門診費用報銷,在職職工為80%，退休職工為85%。
參加城鎮居民醫療保險的居民可享受住院費用報銷和統籌病種門診費用報銷待遇。由于繳費費率較低，因此待遇也相對低一些。參保居民的住院費用報銷，在扣除范圍外費用以后，最低起付線(同城鎮職工醫保)以上的部分，按55%報銷，每個醫療年度最高可累計報銷3萬元。統籌病種門診費用,在起付線(300元)以上的，按50%報銷。